Университетская клиника г. Йена прошла сертификацию Немецкого онкологического сообщества и стала одним из одиннадцати онкологических центров Германии, специализирующихся на опухолях опорно-двигательного аппарата. Зачастую именно рак опорно-двигательного аппарата (например, остеосаркома, остеома, хондросаркома и т.д.) удается распознать лишь на довольно поздних стадиях. К тому же опухоли этого типа относят скорее к редким заболеваниям. Исходя из этого целью онкологического центра в Йене является своевременная специальная диагностика, а также эффективное оперативное лечение.

Онкологический центр тесно сотрудничает с Институтом патологии в Йене, а также с ортопедическим отделением университетской клиники. Это позволяет достигать больших успехов в области реконструкции и протезирования после оперативного вмешательства.